а в чем возникает сложность с сертификатами в покупке дома? Я вообще губу раскатала на дом... 
ну удачи вам конечно, я буду и за вас рада, есть девочки,которые все смогли преодолеть, просто хочется что? - дом, новый, красивый (качественно построенный), с участком, в хорошем месте, не в кукуево, чтоб там дорога была нормальная добираться в цивилизацию (ну или тогда трактор покупать сразу), ну и по цене чтоб приемлемо, для меня приемлемо - это 4млн, участок 3 сотки, дом 2-эт, квадратов 100, это реально, я особо не замахиваюсь на хоромы, поэтому это будет снт, чтоб по сертификату купить - нужно перевести в ижс, но вполне возможно продавец и сам это сделает (стоит как оказалось это не очень дорого, 3-12тр), далее - если дом новый, его построило физлицо на себя оформив при этом - возникает вопрос, кто будет платить налог, хотите чистую сделку - накиньте налог сверх цены, а это порядка 400тр, не хотите накинуть - вот вам договор к-п на сумму 1млн рублей и благоустройство на 3 млн, банк пропустит (и то не каждый), а вот ажп - профинансирует исходя из миллиона, а на счет администрации даже не знаю, как они к этому отнесутся (наверное пошлют). так что в этом только проблема, если это не проблема (ну например есть люди платят ндфл продавцу, ведь госпомощь может превысить эту потерю, и тогда это вполне оправданная жертва, а есть соглашаются получать от ажп копейки, а потом ребтя рожают, закрывают этот миллион и все прекрасно). в вашем случае лучше оформить бумаги по-белому, черт с ним с ндфл, пусть продавец накинет эти 400тр, зато сертификат от администрации с лихвой все покроет.