я не бухгалтер, но попробую ответить
Ситуация такая вполне реальна. Руководство Ваше, для того, чтобы меньше вопросов было у ФСС, могло бы хотя бы перевод на какую-нибудь должность Вам оформить, а не просто так взять и поднять ЗП.
По факту уже того, что сделано. Работодатель не может не платить пособие! Все пособия выплачивает именно он, а в ФСС потом обращается за компенсацией этих расходов. Но они прекрасно понимают, что рискуют заплатить Вам из расчета большой ЗП, а компенсацию получить маленькую. Как тут быть.... ХЗ. Если хотите после декрета работать там же, то наверное не стоит ругаться. В конце концов Вы же знали о том, что ЗП у Вас черная и соглашаясь с этим, понимали все риски. Ну, а если в планах поменять работодателя, то можно жаловаться в ГИТ